سيكون كل نظام تناضح عكسي ملوثًا ويحتاج إلى التنظيف. نظرًا لأنه لا يوجد عادةً ملوث واحد فقط عند حدوث التلوث ، فإن عملية التنظيف المعتادة تتضمن عادةً خطوتين: تنظيف منخفض الأس الهيدروجيني وتنظيف بدرجة حموضة عالية.
يجب تنظيف الملوثات المختلفة بعوامل تنظيف مختلفة. يستخدم التنظيف القلوي بشكل أساسي لإزالة الكائنات الحية الدقيقة أو الملوثات العضوية ، ويستخدم التنظيف الحمضي بشكل أساسي لإزالة القشور. يجب اختيار عامل التنظيف وفقًا لنوع الملوثات ونوع الغشاء لتجنب إتلاف الغشاء.
يجب تحديد تسلسل استخدام عوامل التنظيف وفقًا للمشكلات الفعلية. تسلسل التنظيف المعتاد هو الغسيل بالحمض أولاً ، ثم الغسيل القلوي.
في بعض الحالات ، إذا كان التلوث أساسًا مادة عضوية أو كائنات دقيقة ، فيمكن إجراء الغسيل القلوي أولاً ، يليه الغسيل الحمضي ، ثم الغسيل القلوي.
السبب المهم لأخذ الغسل القلوي كخطوة أخيرة هو أنه يمكنه فتح مسام الغشاء بالكامل بعد التخليل ، وذلك لاستعادة تدفق إنتاج الماء.
